Após as bactérias S. mutans e lactobacilli se estabelecerem na cavidade oral, maior o risco de desenvolvimento de futuras lesões de cárie. Onde o biofilme (placa) se acumula, a contagem bacteriana é considerada mais alta devido à retenção da placa. Dentes recém-erupcionados são deficientes em conteúdo mineral (cálcio e fosfato), o que os torna mais suscetíveis a bactérias. Ao introduzir agentes antimicrobianos, como o fluoreto, a contagem bacteriana será reduzida.